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国际上首个橡胶草高密度SNP遗传图谱构建
天然橡胶 工业原料 三叶橡胶树 橡胶草
2023/7/4
天然橡胶是世界四大工业原料之一，巴西三叶橡胶树一直是天然橡胶的主要来源，但由于种植面积限制、生产成本增加、遗传背景狭窄和病虫害严重等因素，橡胶生产逐渐难以满足需求。因此，开发生产天然橡胶的替代资源具有重要的战略意义和经济价值。
旨在探究DCT基因启动子区甲基化水平和SNP突变对山羊毛色的影响，为探索DCT基因调控山羊毛色变化的机理提供理论依据。本研究以山羊为试验动物，对DCT基因启动子区进行CpG岛预测，设计引物对预测的2个CpG岛富集区域进行亚硫酸氢盐甲基化测序，使用甲基化水平分析软件BISMA统计甲基化位点，比较唐山奶山羊（白色）和南江黄羊（黑色品系）两种不同毛色山羊群体DCT基因启动子区甲基化水平差异。克隆DCT基...
基于SNP标记的桃矮化基因精细定位
桃 矮化基因 SNP 精细定位
2017/11/9
矮化型桃树体矮小、节间短，是盆栽观赏和砧木育种的重要遗传资源。明确矮化性状形成的遗传机制并对桃矮化基因进行精细定位，是建立目标性状分子辅助选种体系和遗传改良的前提，可为有目标的选育矮化观赏桃和砧木品种奠定基础。【方法】以‘05-2-144’（‘97矮’ב鸳鸯垂枝’桃）套袋自交获得的395个后代单株构建的分离群体为材料。参考桃基因组信息并基于Sanger技术开发的SNP标记对亲本和后代单株进行分析...
旨在解析中国地方犬全基因组拷贝数变异（CNV）分布情况，为分析CNV对犬表型变异的影响提供前期基础。本研究采集了16个来自中国不同地方犬品种和9头罗威纳犬共计185头犬的血液样品，使用血液DNA提取试剂盒提取DNA，利用犬170 K SNP芯片和PennCNV软件对中国地方犬进行全基因组范围内的CNV分析。参照Illumina芯片标准操作流程进行芯片扫描和基因分型。将质控后的SNP参考PennCN...
本试验旨在研究猪ZP4基因的SNP在群体中的选择压及其与产仔数的关联性。收集大白猪、长白猪、长大二元猪3个群体共计328头母猪的产仔数记录，利用直接测序法克隆ZP4基因中的SNP位点，采用广义显性模型分析ZP4基因SNP与产仔数的关联性。采用lositan软件，Tajima's D检验和Fu and Li's D检验来检测ZP4的选择压。结果发现，ZP4中共检测到27个SNPs，关联分析表明A26...
SNP genotyping and population genomics from expressed sequences – current advances and future possibilities
SNP genotyping population genomics
2015/12/11
With the rapid increase in production of genetic data from new sequencing technologies,
a myriad of new ways to study genomic patterns in nonmodel organisms are currently
possible. Because genome as...
采用PCR-SSCP方法对种公牛群体雄激素受体(AR)基因5′ 非翻译区(5′UTR)多态性进行检测。结果表明:AR基因5′UTR含有多态性位点;测序结果显示5′UTR的-1 575处存在T→G碱基突变;用最小二乘方法对该基因型与生产性状相关分析显示遗传多态性与精子密度性状呈显著相关,AA型显著高于AB型(P=0.025),对其他性状的影响差异不显著。试验为研究种公牛体内AR基因的生物学作用奠定了...
鸡8个功能基因5′-侧翼区与内含子的SNP多样性比较
鸡 5′-侧翼区 SNP 适应性
2009/9/22
本研究旨在探讨鸡功能基因5′-侧翼区的单核苷酸多态性(SNP)水平。作者以白来航鸡、隐性白洛克鸡、杏花鸡、丝羽乌骨鸡、固始鸡、红色原鸡为材料, 扩增了GH、DDBC1、RIKEN、RASGRP3、IGF1、THRSP、VIP及PRL共8个基因的5′-侧翼区DNA序列。扩增序列全长为8,399 bp, SNP的总数为161个, 平均每52 bp出现一个SNP。8个功能基因5′-侧翼区核苷酸多样性的θ...
基于凝胶基因芯片的SNP检测平台
SNP 检测平台 基因芯片
2008/11/13
将丙烯酰胺修饰的核酸与丙烯酰胺单体、过硫酸铵等混合后点样于丙烯酰胺修饰的玻片上，然后置于真空，在引发剂气化的氛围下促其发生聚合反应形成凝胶并固定于玻片上。通过该方法，不仅可以固定合成的、修饰有丙烯酰胺的寡核苷酸及其类似物，还可以固定修饰了丙烯酰胺的PCR产物。这种在凝胶内三维的固定量比平面的固定量成指数级的提高。杂交后，用电泳替代传统的清洗方法，可以更好地提高信噪比和有效地区分完全匹配的序列和错配...
广东地区汉族人MBL基因启动子区SNP的研究
2007/7/25
甘露聚糖结合凝集素(mannan-binding lectin, MBL)系C型凝集素超家族中胶凝素家族的重要成员，可识别多种病原体的糖结构，通过调理吞噬和激活补体凝集素途径来清除病原微生物和受感染细胞[1][2]，是机体天然免疫系统中的关键分子[3]。已证实血清MBL水平低下与许多感染性疾病尤其是婴幼儿反复感染、自身免疫病(如系统性红斑狼疮和类风湿性关节炎)以及习惯性流产等有关。MBL由肝细胞合...